澳大利亚澳洲航空公司（澳航）自2008年2月29日零时起，在北京首都国际机场所有航班的离港和抵达，将由原来的2号航站楼（T2）搬至新建成的3号航站楼(T3)。

新航站楼的建成缓解了北京日益繁重的交通运输，也是2008年北京奥运会重点工程之一。澳航位于3号航站楼的值机柜台C01-08设置在4楼C通道处。请于航班起飞前三小时到达机场办理登机手续。请注意澳航的值机柜台会在航班起飞前一小时关闭。

交通方面，澳航的乘客可选择机场提供的旅客摆渡车来往1号、2号、3号航站楼。迁至新的航站楼之后，中转乘客从1号、2号航站楼前往3号航站楼需要2小时40分钟；另外，中转乘客在3号航站楼接驳其他航班则需要2小时。

澳航的乘客亦可乘坐设在西单、北京站、公主坟、方庄、中关村、和望京的民航旅客班车直达3号航站楼。

此外，GDS全球分销系统以及qantas.com已更新了澳航在首都机场航站楼的变更信息。

目前澳航每周有3个航班从北京出发直飞悉尼。而在2008年8月4日至8月24日之间，更将为北京奥运会提供每日航班服务。在上海，澳航每周提供5个航班直飞悉尼。从2008年3月10日起，更将提供每周2个航班由上海直飞墨尔本的服务。